Batajnica je po broju stanovnika odavno prevazišla mnoga mesta u Srbiji, a dugo se vodila kao prigradsko selo Zemuna. Potrebe građana Batajnice iziskivale su izgradnju nove crkve, međutim to nije dozvoljavala komunistička vlast. Zahtevi vernika su napokon uslišeni i temelji nove crkve osvećeni su 14. novembra 1992. godine. Veliki sabor crkvenih velikodostojnika i vernika održan je 20. maja 2007. godine kada je povodom završetka crkve obavljeno njeno osveštenje.
Ovom činu prisustvovali su: vladika sremski Vasilije, vladika zapadnoamerički Longin, vladika istočno američki Mitrofan, vladika bihaćko-petrovački Hrizostom, vladika budimski Lukijan i vladika banjalučki Jefrem. Crkva je izgrađena dobrovoljnim prilozima vernika, ali se mora istaći da je opština Zemun pružila najveću finansijsku podršku. Prilikom izgradnje temelja crkve Rođenja Presvete Bogorodice u Batajnici, u temelje crkve postavljena je jedna čestica moštiju Svetog kneza Lazara.
